El Boeing 767 salió de Boston hacia Los Ángeles a las 07:59. El avión fue secuestrado 15 minutos después. Se estrelló contra la Torre Norte de las Torres Gemelas, volando a 708 kilómetros por hora, a las 08:47.

Todos los 92 abordo, incluyendo los dos pilotos y nueve asistentes de vuelo, murieron al instante. Otros 1.462 murieron en el edificio, según la Comisión del 11-S.

Los secuestradores apuñalaron a dos asistentes de vuelo e irrumpieron en la cabina, tomando control del avión. Degollaron a un pasajero. Los secuestradores usaron gas pimienta y la amenaza de una bomba para forzar a los otros a retirarse al fondo del avión.

A las 08:24 los controladores aéreos escucharon la siguiente retransmisión del Vuelo 11: “Tenemos varios aviones. Simplemente quédense quietos y todo irá bien”.

El avión impactó contra la Torre Norte entre los pisos 93 y 99, destruyendo toda opción de escapada para cualquiera que estuviera en el piso 92 o más arriba. Cuatro de los cinco secuestradores eran de Arabia Saudita. El líder y piloto del Vuelo 11, Mohamed Atta, había nacido en Egipto.