Le Bénin est une république unitaire, avec un régime de type présidentiel. La constitution du 11 décembre 1990 indique que le président de la République est à la fois le chef de l'Etat et le chef du gouvernement.

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Il nomme les membres du gouvernement, est le chef suprême des armées, et promulgue toutes les lois votées par l'assemblée nationale, avant leur entrée en vigueur.

L'organisation des élections repose sur des principes énoncés à la fois dans la Constitution du 11 décembre 1990, et dans la loi portant règles particulières pour l'élection du président de la République.

Ces textes prévoient que le Président de la République est élu au suffrage universel direct pour un mandat de cinq ans renouvelable une seule fois, et qu'en aucun cas, nul ne peut exercer plus de deux mandats présidentiels.

La loi dispose en outre que « le Président de la République est élu à la majorité absolue des suffrages exprimés. Si celle-ci n'est pas obtenue au premier tour du scrutin, il est procédé à un second tour, dans un délai de quinze (15) jours courant à partir de la date de la proclamation des résultats du premier tour. Seuls peuvent se présenter au second tour du scrutin, les deux candidats qui ont recueilli le plus grand nombre de suffrages au premier tour. »

Une majorité simple des voix suffit pour déclarer élu au second tour le candidat arrivé en tête, après le dépouillement des suffrages.
L'organisation du scrutin est confiée à la Commission Electorale Nationale Autonome (CENA), mise en place en octobre 2005, et dirigée par Sylvain Nouwatin.

La Commission Electorale publie les résultats provisoires, qui n'ont un caractère définitif qu'après leur approbation par la Cour Constitutionnelle.