La question du financement de l'élection constituait la plus grande menace au calendrier électoral. Le gouvernement avait fait savoir qu'il ne disposait pas de ressources suffisantes pour assurer l'organisation du scrutin, argument rejeté par la Commission Electorale, qui le perçoit comme une manoeuvre visant à faire dérailler le processus.

La crise provoque une série de grèves organisées fin janvier à l'appel des principales centrales syndicales du pays, et de plusieurs organisations de la société civile.

Une affaire de milliards

Selon la Commission Electorale, l'organisation du scrutin devrait coûter environ 18 millions de dollars - près de 10 milliards de FCFA. Mais selon le ministre des Finances, Cosme Sehlin, le scrutin ne peut coûter plus de 12 millions de dollars au maximum (6,5 milliards de FCFA environ.)

Selon le ministre, même en revoyant à la baisse le coût de l'organisation, le gouvernement ne peut en assurer le financement, dans la mesure où le budget de fonctionnement de l'Etat connaît un déficit de 57 millions de dollars - 31,3 milliards de FCFA - qu'il fallait impérativement éviter de creuser.

Ces arguments ont été rejetés en bloc par les syndicats, les ONG et la Commission Electorale Nationale Autonome (CENA).

"Plaisanterie"

Le président de la CENA, Sylvain Nouwatin, a qualifié les déclarations du ministre de « plaisanterie.»

Le gouvernement a par la suite cédé, et libéré une partie des fonds nécessaires à l'organisation du scrutin.

Les bailleurs de fonds du Bénin, soucieux d'éviter une issue violente à la crise, ont également mis la main à la poche, et promis de prendre en charge une partie du budget de fonctionnement de la Commission Electorale.

Parmi les pays donateurs, on retrouve les Etats-Unis, l'Union Européenne, le Programme des Nations unies pour le Développement, et les Pays-Bas.